Als Richard Feynman im Dezember 1959 seine Rede "There's plenty of room at the bottom" hielt, begann die wissenschaftliche Gemeinschaft zum ersten Mal, die mikroskopische Welt auf eine andere Weise zu betrachten. Dieser visionäre Vortrag legte den Grundstein für die spätere Nanotechnologie, d. h. die Schaffung und Manipulation von Materie im Nanometerbereich. Ein revolutionärer Fortschritt in diesem Bereich erfolgte etwa 20 Jahre später, als Ned Seeman vorschlug, DNA als Baustein für Objekte in Nanogröße zu verwenden, um sie später mit einer Vielzahl von Biomolekülen zu funktionalisieren. Damals noch ein Novum ist die Nanotechnologie heute ein fester Bestandteil des täglichen Lebens und mit ihren verschiedenen Facetten in jedem Lehrplan eines naturwissenschaftlichen Studiengangs präsent. Was die Objekte im Nanomaßstab so interessant macht und für jeden, der in diesem Bereich forscht, eine Herausforderung darstellt, ist die Tatsache, dass ihr Verhalten mit Effekten aus der Quantenwelt vermischt ist. Die Tatsache, dass die physikalischen Eigenschaften nanoskaliger Objekte von den aus der klassischen Physik erwarteten Gesetzen abweichen, eröffnet völlig neue Möglichkeiten, insbesondere im Bereich der biologisch-medizinischen Anwendungen. Ein Schwerpunkt in dieser Richtung ist die Manipulation von inter- und intrazellulären Prozessen, sodass diese nanoskaligen Objekte als Therapeutika eingesetzt werden können. Im Bereich der Bionanotechnologie sind DNAbasierte Konstrukte aufgrund ihrer einfachen Realisierung und hochspezifischen Funktionalisierung sehr beliebt. Der Fokus liegt jedoch nicht mehr auf der Herstellung solcher Strukturen, sondern auf deren Funktionalisierung. In dieser Arbeit soll die Konjugation unterschiedlich modifizierter DNA-Origami-Komplexe mit der Hitzeschockprotease DegP als Modellprotein untersucht und im Hinblick auf das Bindungsverhalten, die Bindungseffizienz sowie die Spezifität der Bedingungen beschrieben werden. Die Arbeiten haben zwei Schwerpunkte: 1. die Untersuchung des Einflusses und der Manipulation der Oberflächenladung der beteiligten Moleküle und 2. der Einfluss der Anzahl und Anordnung der bindungsvermittelnden nicht-kovalenten Liganden sowie die Rolle der Entropie in Bezug auf die Häufigkeit der Bindungsereignisse. Dazu werden elektrophoretische und fluoreszenzbasierte Methoden eingesetzt. Die Transmissionselektronenmikroskopie wurde als bildgebendes Verfahren eingesetzt. Generell wird gezeigt, dass die Funktionalisierung von DNA-basierten Strukturen durch die Kenntnis der spezifischen Mechanismen rational manipuliert und effizienter gestaltet werden kann.